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16S/18S/ITS等扩增子测序服务

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16S/18S/ITS等扩增子测序服务

产品描述信息

  扩增子测序通过对一定长度的PCR扩增子进行测序,研究环境样品中的微生物多样性,主要包括16S rDNA测序(用于细菌或古菌多样性研究)、18S rDNA测序和ITS测序(用于真菌或微小动植物等多样性研究)等。通过提取环境样品的DNA,选择合适的通用引物扩增16S/18S/ITS序列的某一或某几个高度变异区,采用Illumina MiSeq高通量测序平台将目的区域正反向读通,通过检测目的区域的序列变异和丰度,对环境样本物种分类及丰度、种群结构、系统进化、群落距离等方面信息进行分析。探讨微生物多样性,对于研究微生物与环境的关系、环境治理和微生物资源利用有着重要的理论和现实意义   

产品详细信息

   研究所有环境样品(包括土壤、水体和肠道等环境)中微生物物种分类、群落结构、多样性、差异微生物和样品间群落比较等。

l准确性高:从碱基保守水平测定,真实反映物种情况;

l鉴定高效与传统鉴定方法相比,具有通量大、产出数据多、速度更快;

l灵敏度高可以鉴定到低丰度微生物;

l低成本:需测序数据量少,检测成本低;  

根据客户需求定制研究方案和分析内容 。


生物信息数据分析内容

标准生物信息分析 

  • 测序结果质量评估

Ø测序数据统计

Ø序列拼接

Ø低质量序列过滤

ØOTU聚类

Ø物种分类

  • 群落结构及多样性分析

Ø样本群落组成分析

Ø多样性指数

Ø稀释曲线

ØShannon曲线

ØRank Abundance曲线

ØOTU分布Venn

ØHeatmap

ØPCA主成分分析

Ø差异微生物筛选

Ø差异微生物火山图

高级生物信息分析

u系统发育树

uNMDS分析

uRDA/CCA分析

特别声明1.未列出的分析请咨询技术支持。

        2.请以合同及实际分析内容为准。

个性化定制分析

 源宜基因会根据您的研究需求提供个性化的分析,共同协商后绘制定制化的分析图表。

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